Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prm3Q62100 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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Prm3Q62100 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Prm3Q62100 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Prm3Q62100 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prm3Q62100 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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Prm3Q62100 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Prm3Q62100 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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