Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
AtrxQ61687 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
AtrxQ61687 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms