Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Gli3Q61602 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Gli3Q61602 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Gli3Q61602 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Gli3Q61602 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms