Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lamb3Q61087 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb3Q61087 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lamb3Q61087 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms