Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Vdac1Q60932 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vdac1Q60932 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms