Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Samhd1Q60710 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Samhd1Q60710 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms