Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PtprnQ60673 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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PtprnQ60673 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PtprnQ60673 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms