Protein–RNA interactions for Protein: Q5UKY4

Cd200r3, Cell surface glycoprotein CD200 receptor 3, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd200r3Q5UKY4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd200r3Q5UKY4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cd200r3Q5UKY4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms