Protein–RNA interactions for Protein: Q5T215

TRAPPC3L, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3LQ5T215 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TRAPPC3LQ5T215 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TRAPPC3LQ5T215 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TRAPPC3LQ5T215 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms