Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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Sco1Q5SUC9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sco1Q5SUC9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Sco1Q5SUC9 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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Sco1Q5SUC9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Sco1Q5SUC9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Sco1Q5SUC9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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Sco1Q5SUC9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Sco1Q5SUC9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms