Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r223Q5SSA0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r223Q5SSA0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vmn1r223Q5SSA0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r223Q5SSA0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r223Q5SSA0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms