Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Bhlha9Q5RJB0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Bhlha9Q5RJB0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms