Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rtl5Q5DTT4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rtl5Q5DTT4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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Rtl5Q5DTT4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
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Rtl5Q5DTT4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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Rtl5Q5DTT4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rtl5Q5DTT4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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