Protein–RNA interactions for Protein: Q505D1

Ankrd28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28Q505D1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd28Q505D1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd28Q505D1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd28Q505D1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd28Q505D1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd28Q505D1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms