Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ddx49Q4FZF3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ddx49Q4FZF3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms