Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2D6

Krtap1-4, Keratin-associated protein 1-4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap1-4Q3V2D6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Krtap1-4Q3V2D6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms