Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI4

Tmed8, Protein TMED8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed8Q3UHI4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed8Q3UHI4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed8Q3UHI4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed8Q3UHI4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tmed8Q3UHI4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmed8Q3UHI4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tmed8Q3UHI4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tmed8Q3UHI4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tmed8Q3UHI4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms