Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Vars2Q3U2A8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Vars2Q3U2A8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Vars2Q3U2A8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms