Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc102aQ3TMW1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc102aQ3TMW1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms