Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG1

Rhox4c, MCG125587, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4cQ2MDG1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rhox4cQ2MDG1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rhox4cQ2MDG1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms