Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rhox4dQ2MDG0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rhox4dQ2MDG0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms