Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Spatc1Q148B6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spatc1Q148B6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spatc1Q148B6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms