Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shisal1Q0VBP7 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shisal1Q0VBP7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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