Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Itgb8Q0VBD0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Itgb8Q0VBD0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms