Protein–RNA interactions for Protein: Q08EJ0

Plac8l1, PLAC8-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plac8l1Q08EJ0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Plac8l1Q08EJ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Plac8l1Q08EJ0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Plac8l1Q08EJ0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Plac8l1Q08EJ0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Plac8l1Q08EJ0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Plac8l1Q08EJ0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Plac8l1Q08EJ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms