Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Cnn2Q08093 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cnn2Q08093 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms