Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sox9Q04887 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sox9Q04887 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms