Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Emx2Q04744 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Emx2Q04744 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Emx2Q04744 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms