Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thbs2Q03350 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Thbs2Q03350 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Thbs2Q03350 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms