Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
OTUD4Q01804 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
OTUD4Q01804 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OTUD4Q01804 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms