Protein–RNA interactions for Protein: Q01730

Rsu1, Ras suppressor protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsu1Q01730 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rsu1Q01730 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rsu1Q01730 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsu1Q01730 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rsu1Q01730 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rsu1Q01730 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms