Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
EgfrQ01279 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EgfrQ01279 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EgfrQ01279 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms