Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Scn1bP97952 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Scn1bP97952 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms