Protein–RNA interactions for Protein: P86793

Ccl21c, C-C motif chemokine 21c, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl21cP86793 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccl21cP86793 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccl21cP86793 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms