Protein–RNA interactions for Protein: P82198

Tgfbi, Transforming growth factor-beta-induced protein ig-h3, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfbiP82198 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TgfbiP82198 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TgfbiP82198 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms