Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Irx3P81067 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Irx3P81067 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Irx3P81067 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms