Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX1P78337 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX1P78337 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX1P78337 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PITX1P78337 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PITX1P78337 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX1P78337 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX1P78337 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX1P78337 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PITX1P78337 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PITX1P78337 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PITX1P78337 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PITX1P78337 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PITX1P78337 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PITX1P78337 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PITX1P78337 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms