Protein–RNA interactions for Protein: P70704

Atp8a1, Phospholipid-transporting ATPase IA, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8a1P70704 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8a1P70704 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8a1P70704 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8a1P70704 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8a1P70704 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atp8a1P70704 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atp8a1P70704 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms