Protein–RNA interactions for Protein: P70689

Gjb6, Gap junction beta-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb6P70689 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gjb6P70689 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gjb6P70689 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms