Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Stra8P70278 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stra8P70278 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Stra8P70278 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stra8P70278 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms