Protein–RNA interactions for Protein: P70195

Psmb7, Proteasome subunit beta type-7, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb7P70195 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Psmb7P70195 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Psmb7P70195 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Psmb7P70195 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Psmb7P70195 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Psmb7P70195 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms