Protein–RNA interactions for Protein: P68037

Ube2l3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2l3P68037 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ube2l3P68037 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ube2l3P68037 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms