Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab11aP62492 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab11aP62492 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms