Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Tm6sf1P58749 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tm6sf1P58749 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms