Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Sssca1P56873 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Sssca1P56873 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms