Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efna1P52793 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna1P52793 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efna1P52793 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Efna1P52793 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Efna1P52793 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms