Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ApodP51910 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApodP51910 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApodP51910 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApodP51910 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ApodP51910 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ApodP51910 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ApodP51910 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApodP51910 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApodP51910 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApodP51910 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApodP51910 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApodP51910 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ApodP51910 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ApodP51910 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ApodP51910 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ApodP51910 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ApodP51910 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms