Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nkx2-1P50220 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-1P50220 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms