Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMUP48645 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMUP48645 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMUP48645 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NMUP48645 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NMUP48645 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NMUP48645 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NMUP48645 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms