Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pax9P47242 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pax9P47242 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms